TK Katolik Santa Clara didirikan dengan tujuan untuk menyediakan pendidikan yang berkualitas bagi masyarakat. Berdirinya sekolah ini merupakan hasil dari upaya para Suster Misionaris Claris dari Mexico yang ingin meningkatkan kualitas pendidikan di Indonesia, khususnya Surabaya.
Pendiri Kongregasi ini adalah Madre maria Ines Teresa Arias Espinosa berkebangsaan Mexico.
Sekolah Santa Clara dapat berdiri di samping Gereja Santa Maria Tak Bercela berkat bantuan dari RM. H. Maessen CM Pastor Paroki Ngagel.
Perkembangan sekolah Santa Clara sangat pesat hingga sekarang memasuki usia 56 tahun dengan prestasi-prestasi yang meningkat dan program-program yang mengikuti perkembangan jaman dengan penuh kreatif, inofatif, dan berdaya guna dengan tidak melupakan Pendidikan karakter dan nilai-nilai kristiani sebagai landasan utama.